大マゼラン雲と小マゼラン雲は、マゼラン帝国が支配している。
ダイダロス銀河連邦とアンドロメダ銀河連合の両方と不可侵条約を結んでおり、両国との紛争には中立の立場をとっている。
ただ、アトランティス帝国とは崩壊前には文化交流があったとのうわさがある。
マゼラン帝国は、両陣営とは交流を待たないが、どちらかといえば、同じ有機生命体であるアンドロメダ銀河連合とはアンダーグラウンドで貿易が行われている。
実はアトランティス暫定自治区の秘密口座(交流があった時代は秘密ではなかった)もこのマゼラン帝国にあり、闇ブローカーを通じて銀河間為替取引に参加しこの利益で国家予算を編成している。
